원발성 생리통의 경우는 대개 하복부의 정중앙이나 치골 바로 위 부위에 둔중하고 쥐어짜는 듯한 통증을 유발합니다. 자궁내막증이 있는 경우에는 지속적으로 찌르는 듯한 통증이 배 옆쪽이나 직장 근처의 골반 깊숙이에서 느껴지게 되며, 대변을 보는 경우나 성교시에는 특히  심한 통증을 느끼게 됩니다. 생리를 할 때 허리에 통증을 느끼는 이유는 자궁이 수축되어 자궁에 분포하는 신경의 자극이 요통을 유발시키기 때문이라 생각됩니다.